波茨坦大學建於1991年，位於歷史名城波茨坦，它與德國著名宮殿Sansusici相鄰，是德國最年輕又是最為漂亮的高等學府，它成功發展成了一座綜合性的世界聞名的高等學府，2009年10月，波茨坦大學從十所德國高校中脫穎而出，被德意志科學基金贊助者聯合會（Stifterverband für die Deutsche Wissenschaft）和德國文化部長常設會議（Kultusministerkonferenz）授予“卓越教學（德語：Exzellenz in der Lehre）”榮譽現有兩萬名學生在此就讀。 1991年7月15日，根據《勃蘭登堡州高等院校法》，原來的波茨坦勃蘭登堡州立高等學校（BrandenburgischenLandeshochschulePotsdam，前身為1948年至1951年間的“卡爾·李卜克內西”教育高等學校（PädagogischeHochschule"KarlLiebknecht"））和波茨坦-巴貝斯堡法學及行政學高等學校（HochschulefürRechtundVerwaltungPotsdam-Babelsberg，前身為“瓦爾特·烏布利希”德意志國家和法律科學院（德語：DeutscheAkademiefürStaats-undRechtswissenschaft„ WalterUlbricht“））合併，成立了年輕的波茨坦大學。正因如此，波茨坦大學的重點之一仍然是師範教育。建校時任校長的是化學家、後來的勃蘭登堡聯邦州憲法法庭法官羅爾夫·米茨納（德語：RolfMitzner）。

　　位於戈爾姆（德語：Golm）的前東德國家安全部高等學校（德語：HochschuledesMinisteriumsfürStaatssicherheit）校區，如今也屬於波茨坦大學，是人類學、數學-自然科學學院所在地。

2009年10月，波茨坦大學從十所德國高校中脫穎而出，被德意志科學基金贊助者聯合會（StifterverbandfürdieDeutscheWissenschaft）和德國文化部長常設會議（Kultusministerkonferenz）授予“卓越教學（德語：ExzellenzinderLehre）”榮譽，獎金一百萬歐元。儘管這之前《UniversalAlgebraandApplicationsinTheoreticalComputerScience》曾受到抄襲指控。